Uma das kekkei genkais mais poderosas é a fusão de elementos. Alguns indivíduos conseguem juntar dois ou mais tipos de chakra de forma a produzir um novo elemento, muito mais poderoso.

Mokuton (madeira) – Fusão de Doton com Suiton
Esta técnica pode ser utilizada tanto como defesa (muralhas, etc) como ataque.
Também é possível “produzir” árvores e casas feitas em madeira.

Ranton (tempestade) – Fusão de Suiton com Raiton
É somente uma técnica ofensiva dado que produz uma espécie de laser que é capaz de causar grandes explosões.

Shouton (cristal) – Fusão de Doton, Suiton e Fuuton
Pode ser usado para defesa mas tem um grande poder ofensivo na medida que é possível criar qualquer tipo de objecto (shurikens por exemplo) ou mesmo aprisionar o adversário.

Hyouton (gelo) – Fusão de Suiton com Fuuton.
Técnica que pode ser usada para defesa e ataque.

Jinton (poeira) – Fusão de Doton com Fuuton
Pode ser usado para pulverizar tudo em seu redor.

Youton (lava) – Fusão de Katon com Doton
A lava funciona apenas como componente ofensiva visto que destrói tudo à sua passagem.

Futton (ácido) – Fusão de Suiton com Katon
Com este ácido é possível derreter tudo em que entre em contacto, podendo o ácido ser liquido ou gasoso.